股东不同意注销公司的，可以在解散公司等决议上投反对票，但如果股东会或者股东大会仍然以三分之二多数表决通过的，则公司仍然需要依法办理注销登记的手续。
《中华人民共和国公司法》第一百零三条 股东出席股东大会会议，所持每一股份有一表决权。但是，公司持有的本公司股份没有表决权。 股东大会作出决议，必须经出席会议的股东所持表决权过半数通过。但是，股东大会作出修改公司章程、增加或者减少注册资本的决议，以及公司合并、分立、解散或者变更公司形式的决议，必须经出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。
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