法律分析：协议书中甲方乙方的签字是否用公司的名称，要看这个协议的主体是谁，如果是公司，由公司承担权利义务的，那协议签字时应该是盖公司的公章，由法定代表人或被授权人签字。
法律依据：《中华人民共和国民法典》 第四百九十条 当事人采用合同书形式订立合同的，自当事人均签名、盖章或者按指印时合同成立。在签名、盖章或者按指印之前，当事人一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。法律、行政法规规定或者当事人约定合同应当采用书面形式订立，当事人未采用书面形式但是一方已经履行主要义务，对方接受时，该合同成立。
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