办理土地证，邻居拒不在四邻协议上签字，可按照以下方法处理：在房屋建成后，当事人向国土资源局申请办理国有土地使用权证，然后根据《土地登记办法》第九条之规定，将地籍调查表提交给四邻签字确认，如有邻居拒绝签字，可向国土资源局说明情况，按违约缺席指界程序处理。
法律依据:
《土地登记办法》
第一条 为规范土地登记行为，保护土地权利人的合法权益，根据《中华人民共和国物权法》、《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国城市房地产管理法》和《中华人民共和国土地管理法实施条例》，制定本办法。
第二条 本办法所称土地登记，是指将国有土地使用权、集体土地所有权、集体土地使用权和土地抵押权、地役权以及依照法律法规规定需要登记的其他土地权利记载于土地登记簿公示的行为。前款规定的国有土地使用权，包括国有建设用地使用权和国有农用地使用权；集体土地使用权，包括集体建设用地使用权、宅基地使用权和集体农用地使用权（不含土地承包经营权）。
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