1986年底，顾诵芬调到航空工业部科技委任副主任。尽管离开了飞机设计一线，但是他并没有放弃对于航空装备的关注，并且在科技委主要负责预研工作。
在此后的工作中，他先后组织负责了战斗机主动控制技术(ACT)的预研，并取得成功和推广应用。1994年，他组织王道荫、钟铭钰和620所、628所的同志一起，经过飞机、发动机、武器、电子等30多位专家讨论、审议，形成了对现有军机提高作战能力的初步建议，被当时的航空工业总公司采纳。1996年，组织和参与了歼7E改进建议的拟定工作，年底形成了报告;组织和参与了歼8D改进的建议拟定工作，形成了建议报告;组织和参与了轰6改进的建议报告拟定，形成了建议报告。
1997年，撰写了15年军机发展规划初稿。
1999年以来，顾诵芬领导科技委飞机专业组开展了大量的研究，涉及民机、大型飞机(包括大型客机和军、民用运输机)、轰炸机、高超声速飞行器、无人机、教练机、轻型多用途战斗机、外贸机及CFD技术等。形成的研究报告、咨询报告和建议书达20多份。为企业的发展提供了指导意见，为航空工业和国家决策提供了依据，促进了飞机技术的发展。
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