避孕药会对维生素Be的代谢产生影响。这主要是由于避孕药中的雌激素可增力口肝脏色氨酸氧化酶的活性，使色氨酸代谢增强，而维生素Bs是色氨酸代谢过程中的一种辅助成分。此外，雌激素还可使谷丙转氨酶和谷草转氨酶的活性增加，这些酶均需维生素Bs作为辅酶，所以引起维生素Be的消耗增加，由于维生素Bs与色氨酸代谢有关，而后者又与脑的功能有关，所以维生素Bs的缺乏又是服用避孕药时精神抑郁的重要原因之一。
服用避孕药对维生素B12也有影响，可使其在血中浓度降低，维生素B12是造血过程必需的物质，它的缺乏会影响造血机能，有人对1100例服用避孕药的妇女和1600例不服用的妇女进行了调查，发现服用避孕药的妇女血红蛋白、和红细胞数等均低于不服用的妇女，服用时间长的妇女更为明显。
维生素B12的良好来源有：动物内脏、贝壳类、奶粉、鱼、蟹和蛋黄等。服用避孕药的妇女平时应注意摄入这些食品。如果已经发生缺乏症，则应肌肉注射维生素B12。
服用避孕药的妇女应注意预防维生素B6的缺乏，多摄入一些富含维生素B6的食物，如谷类食品、蔬菜及肉、蛋、乳类等，必要时每日口服小剂量的维生素B6片剂。已经发生缺乏症的，则需口服大剂量维生素B6，每日25毫克左右才能得到纠正。
服用避孕药的妇女血中叶酸水平常常降低。这主要是由于抑制了十二指肠黏膜的叶酸结合酶。这种酶是肠道吸收叶酸所必需的，它的抑制使叶酸吸收减少。叶酸在血液的红细胞生成中有重要的作用，少数服用避孕药的妇女偶尔可发生缺乏叶酸而引起贫血。