看过南庵，沿这个石径拾级而上，经170多个台阶可至北洞。眼前大门为北洞山门，俗称“一天门”。门额上“灵佑门”三个字为明代礼部尚书王图题刻。门旁石碑上“五台山”三个大字则为明代知州江从春所题。
进入山门，我们就来到了北洞。北洞亦称太玄洞或药王大殿，是明代以后人们为纪念孙思邈而修建的另一处殿宇。因此，当地百姓常说“先有南魔，后有北洞”。北洞建于明代，占地约1137平方米。其外观古朴壮观，细部雕刻精致。药王坐殿是北洞古建的主体。殿内正中塑有药王孙思邈彩像一尊，像高3米，身穿杏黄长袍，头披方巾，温和端庄，和蔼可亲。彩像背后有一石洞，长约20公里，名日“穿龙洞”。传说该洞为一龙王所钻，药王在此曾为其治病。后来，约王也在此处化羽成仙。因而此处香火甚旺，常年不断。当地百姓有“前洞烧香，后洞冒烟”之说。
出坐殿，在大殿院内可见石碑数通。此碑为 《千金宝要》碑，在院内碑中最为有名。《千金宝要》是北宋通奉大夫郭思摘孙思邈《千金要方》之精华而选编的一部药书，内容涉及妇、儿、内、外各科中的一些常见病和多发疾病。1572年，为使其广为流传以达到治病救人之目的，秦王朱守中以小楷形式将《千金要方》刻于碑石之上。碑中收录药方9000多个，分六卷十一科，是一部简化了的《千金要方》版本，是中国乃至世界上最早、最完整的医方碑。因其所载药方简单、便利、行之有效且药品价格低廉，所以各方百姓常手抄拓印，带回家中以备应急。这通碑名叫《海上方碑》，同为明时秦王朱守中所刻。它采用歌谣形式，集药王的《枕上记》、《养生铭》和其他100多个民间药方为一体，内容主要涉及养生保健等知识。因传是龙王为感谢药王救子之恩而赠之药方，故名《海上方》。
药王坐殿对面这座殿宇为十大名医殿。我们现在看到殿内这些坐像为我国古时著名的十大名医。他们分别是歧伯、雷公、扁鹊、仓公、张仲景、华伦、王叔和、皇甫谣、葛洪和陶弘景。每个坐像前都有标牌注明每个名医的姓名和其功绩以供游人怀念瞻仰。
现在我们位于北洞门外的西侧。面前这个巨石上的两个百盆内常年积水，旁边可见 “石盆仙迹”四字。相传孙思邈常在此淘洗所采集的草药，因此得名“洗药池”。